Segments variable et constant des anticorps.

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Extrait du B.O. n°5 du 30 Août 2001 - Programme officiel de Terminale S - SVT

Immunologie

Activités envisageables.

Les processus immunitaires mis en jeu - Généralisation

Les anticorps : agents du maintien de l’intégrité du milieu extracellulaire :
La séropositivité pour le VIH correspond à la présence d’anticorps spécifiques contre certaines protéines du virus.
La synthèse d’anticorps est la signature d’une réaction de l’organisme à la présence d’éléments étrangers.
Les anticorps sont des effecteurs de l’immunité acquise.
Ils agissent dans le milieu extracellulaire (ou milieu intérieur) en se liant spécifiquement aux antigènes qui ont déclenché leur formation.
Les anticorps sont des immunoglobulines, protéines circulantes du milieu intérieur constituées d’une partie constante et d’une partie variable.
La spécificité des anticorps est due à la partie variable.

La liaison antigène – anticorps entraîne la formation de complexes immuns, favorisant l’intervention de mécanismes innés d’élimination de ces complexes.

Utilisation de banques de données permettant d’étudier les séquences d’acides aminés correspondant aux différentes parties des anticorps.

 

Utilisation de logiciels de modélisation moléculaire montrant les anticorps et la réaction antigène-anticorps.

 

 

Expériences montrant la formation d’un complexe antigène-anticorps : test d’Ouchterlony.

 

L'Alignement de Séquence Multiple 3D permet en quelques clics de souris de comparer les séquences de différentes molécules et faire apparaître les ressemblances et différences sur une molécules en 3D. Cinq chaînes légères d'anticorps de Souris sont ici comparées.

Familiarisez vous avec l'outil ASM3D avec le tutoriel spécifique.

Le listing de l'alignement de la séquence de divers anticorps fait apparaître qu'une partie de la séquence est très conservée alors qu'une autre partie de cette s"équence est très différente d'une chaîne à l'autre. La visualisation de ces différente sur une molécule en 3D permet de situer toutes les différences sur le segment de la chaîne légère portant le site de fixation à l'antigène.

Alignements au format FASTA de séquences de différentes chaînes H et L d'anticorps.
(réalisés à partir du site Biology Workbench)

L'alignement comprend les séquences de cinq chaînes légères et de cinq chaînes lourdes (Fragment AB) d'anticorps de Souris.

Chaînes légères (L)

Données Fasta :

Chaîne lourdes (H)

Données Fasta :

Voir comment utiliser ces données sur la page consacrée à la famille multigénique des globines.
Le fragment de reconnaisance de l'antigène (Fab) de l'anticorps lié à l'antigène.
Variabilité de la
chaîne L du Fab
Variabilité de la
chaîne H du Fab

Segment constant et
segment variable du Fab
lié à l'antigène

   

Si votre machine est correctement configurée, pour étudier les portions variable et constante des anticorps :
 

Entrer le code PDB d'une des molécules à étudier dans la case de la page d'entrée puis de cliquer sur le bouton Protéine explorer. Cliquer sur le lien ci-dessous
pour lancer Protéine explorer qui télécharge
automatiquement la molécule indiquée.

1fdl : anticorps anti-lysozyme
1e6j : anticorps anti-HIV
1iai : anticorps et anti-anticorps
3hfm : anticorps anti-lysozyme