| Contraintes techniques d'utilisation |
Containtes techniques d'utilisation de Protéine Explorer. Pourquoi toutes ces contraintes ! Protéine Explorer est un ensemble utilisant divers compléments au langage HTML qui lui donne toutes ses caractéristiques d'interactivité et de simplicité, le Javascript, un plug-in et des cookies. Son bon fonctionnement ne peut se faire que dans un environnement particulier que l'on peut résumer ainsi :
Sans la bonne configuration vous ne pourrez pas consulter PE. Tous ces éléments sont téléchargables gratuitement (Le jeu en vaut la chandelle) sinon, ou en attendant, il est possible de consulter la découverte en images de Protéine Explorer.
Même lorsque la bonne configuration est en place le fonctionnement de PE en connexion peut être lent. En effet PE fait appel à de nombreux fichiers pas toujours visibles à l'écran qu'il faut rapatrier sur votre machine. Pour contourner cette difficulté téléchargez PE et installez le sur votre machine ses performances en seront décuplées.
| Qu'est ce que Protéine Explorer ? |
Qu'est ce que Protéine Explorer? PE est un site intégrant un outil de visualisation moléculaire Chime commandé essentiellement par le clic de la souris sans qu'il soit nécessaire d'avoir la moindre notion d'informatique. Il s'agit de se concentrer sur la molécule et d'oublier le logiciel. Il autorise l'exploration ou la comparaison de molécules de manière très simple et très conviviale. De plus son fonctionnement est interactif c'est à dire qu'il ne vous conduit pas sur une voie prédéterminée c'est à chaque utilisateur de tracer sa voie selon l'aspect de la molécule qu'il étudie. PE comporte deux modules :
| Le principe de fonctionnement |
Le principe de fonctionnement de PE :
PE utilise le plug-in Chime pour la visualisation des molécules. Un plug-in est un logiciel fonctionnant dans le navigateur qui l'assiste dans certaines tâches. Ce plug-in doit être installé sur le disque dur de votre machine pour pouvoir fonctionner dans le navigateur. Chime est téléchargeable gratuitement sur le site de MDLI (voir instructions d'installation). C'est Chime qui permet la visualisation des molécules.
PE constitue un environnement autour de Chime qui permet à l'utilisteur de contrôler le plug-in à partir de quelques clics de souris sur des boutons, des menus déroulants ou des liens hypertextes explicites. De plus PE fournit simultanément une aide et des explications sur les actions encours et les commandes utilisables se qui fait que pour l'utilisateur de base (un élève ou une personne débutant dans la visualisation des molécules par exemple) l'ensemble est transparent et très simple d'utilisation. Pour cela PE utilise le javascript, une forme de programmation qui fonctionne dans le navigateur, qui convertit le clic de souris en commandes vers Chime pour obtenir le résultat escompté.
Ces particularités expliquent pourquoi une configuration particulière de votre machine est nécessaire pour utiliser PE:
Netscape Communicator 4.7 et pas Netscape 6 ou i Intenet Explorer pour deux raisons différentes. Dans ces dernières versions Netscape a fait le choix de ne plus permettre l'intégration de plug-in et donc Chime n'est plus utilisable dans ces versions de Netscape. Quant à Internet Explorer, Microsoft a fait le choix de ne pas permettre la lecture de tout le langage Javascript dont celui utilisé par PE.
| Limites de la version Française |
Limites de la version française. Traduire PE revient à prendre la place de Sisyphe sur sa montagne ! Des versions améliorées de PE sont publiées au plus tous les 3 mois, ce qui est beaucoup plus rapide que le rythme de la traduction. De plus l'objectif est ici surtout de mettre à disposition des élèves et des enseignants francophones un outil puissant de visualisation moléculaire. On trouvera donc ici la version française de la page "vide" dans laquelle on charge la molécule de son choix et l'aide minimale pour la prise en main de PE ainsi que des exemples illustrés d'application de PE dans nos classes.
Les limites portent surtout sur toute l'aide qui accompage PE qui est d'une richesse extrême et pour l'instant beaucoup trop volumineuse pour être traduite. Nous espérons petit à petit gagner le sommet de la montagne et aussi nous y maintenir. Pour suivre cet évolution consultez l'historique de PEvf.
Seule la version pour Windows 95 et plus a été testé mais des versions pour d'autres plateformes existent. Rendez vous sur le site original pour vérifier si vous trouvez la version adéquat.
Visitez le site original qui est beaucoup plus riche que celui-ci et offre une multitude d'options toutes plus attrayantes les unes que les autres.
| Historique |
18 Mars 2001 : Dans cette rubrique apparaitront les évolutions futures de la version française de Protéine Explorer. La rapidité avec laquelle évolue PE vo oblige à des remaniements constants qui seront indiqués ici au fur et à mesure. Cela doit permettre de mettre à jour régulièrement les versions de PEvf.
Un exemple pour illustrer cet historique. Lorsque nous avons entrepris la traduction de PEvo en Novembre 2000, la version en cours était la version 1.71 beta. Il y a eu depuis 5 versions pour en arriver aujourd'hui à la version 1.85 beta. Evidemment toutes les modifications apportées d'une version à l'autre ne sont pas toutes fondamentales mais elles complètent souvent les versions antérieures. La version servant de référence à la vf actuelle est la version 1.80.
| Evolution |
L'ambition de ce travail n'est pas forcement de tenir absolument à jour l'évolution de P.E. mais surtout de fournir aux élèves et aux enseignants francophones un outil simple d'utilisation et efficace. L'évolution de PEvf se fera donc selon le temps disponible et selon les améliorations de PEvo jugées pertinentes par rapport à ce critère d'utilisation en classe.