La structure des anticorps.

La page fournit :

Des extraits des programmes officiels indiquant les parties pouvant être abordées à partir d'outils de visualisation de molécules tel que Protéine Explorer.
Des images illustrant ces textes réalisées avec Protéine Explorer.
Des images des fonctionnalités de Protéine Explorer ayant servis à obtenir l'aspect de la molécule présentés sur les images.
(Cette liste n'est pas exhaustive, elle n'indique que quelques fonctions de PE.)
Des liens qui lancent directement Protéine Explorer et télécharge automatiquement via Internet les molécules indiquées.
(Ceci ne fonctionne que si la configuration de votre machine est complète.)

Extrait du B.O. n°5 du 30 Août 2001 - Programme officiel de Terminale S - SVT

Immunologie

Activités envisageables.

Les processus immunitaires mis en jeu - Généralisation

Les anticorps : agents du maintien de l’intégrité du milieu extracellulaire :
La séropositivité pour le VIH correspond à la présence d’anticorps spécifiques contre certaines protéines du virus.
La synthèse d’anticorps est la signature d’une réaction de l’organisme à la présence d’éléments étrangers.
Les anticorps sont des effecteurs de l’immunité acquise.
Ils agissent dans le milieu extracellulaire (ou milieu intérieur) en se liant spécifiquement aux antigènes qui ont déclenché leur formation.
Les anticorps sont des immunoglobulines, protéines circulantes du milieu intérieur constituées d’une partie constante et d’une partie variable.
La spécificité des anticorps est due à la partie variable.
La liaison antigène – anticorps entraîne la formation de complexes immuns, favorisant l’intervention de mécanismes innés d’élimination de ces complexes.

Utilisation de banques de données permettant d’étudier les séquences d’acides aminés correspondant aux différentes parties des anticorps.

Utilisation de logiciels de modélisation moléculaire montrant les anticorps et la réaction antigène-anticorps.

Expériences montrant la formation d’un complexe antigène-anticorps : test d’Ouchterlony.

La première vue de Protéine fournit des indications permettant très rapidement de comprendre la structure de l'anticorps. On y distingue 4 chaînes (deux courtes et deux longues) reliées pas des ponts disulfures. Des ligands (glucides, ici) sont liés aux deux chaînes longues.
En cliquant sur le lien Explorer Plus! Protéine Explorer offre de nombreuses options permettant d'affiner la lecture de la structure de l'anticorps.
(L'image est une capture d'écran, aucun lien n'est donc actif sur celle ci.)

L'anticorps :
Une molécule de quatre chaînes.	Une molécule soluble	Une molécule en Y

AFFICHER Sphères COLORER Chaînes	AFFICHER Sphères COLORER polarité2 acides aminés hydrophiles acides aminés hydrophobes	AFFICHER Surface

La stucture des chaînes lourdes et légères est similaire.
Elles sont constituées de domaines globulaires présentant des structures comparables. Deux pour la chaîne légère, Quatre pour la chaîne lourde.

Les images sont obtenues à partir de l'Etude Rapide de Protéine Explorer.

CHOISIR Chaîne H ou Chaîne L selon le cas (chaine H, chaine L).

puis

AFFICHER Uniquem.
AFFICHER Sphères
COLORER Chaînes
pour obtenir les images unicolores des chaînes.

AFFICHER Uniquem.
AFFICHER Rubans
COLORER Structure
pour obtenir les images qui indiquent la structure secondaire des chaînes :

Hélice ALPHA
Feuillet BÊTA
PLI
Autre

Si votre machine est correctement configurée, pour étudier la famille multigénique, il suffit :

Source de la molécule: INRP (Bio-Géo)
Attention, il s'agit d'un gros fichier (690 Ko) le temps de téléchargement est long.
Une version compressée est disponible pour téléchargement sur le site de l'INRP,
ainsi que des scripts pour la découverte guidée de la molécule.

Copier et coller l'adresse ci contre de la molécule à étudier dans la fente d'adresse URL de la page d'entrée puis cliquer sur le bouton Charger pour lancer Protéine explorer qui télécharge automatiquement la molécule indiquée.		IGG complet : http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/igglys/iggtotal.pdb
Cliquer sur le lien ci-contre pour lancer Protéine Explorer qui télécharge automatiquement la molécule indiquée.		Charger l'anticops complet (Iggtotal.pdb)