La page fournit :
Extrait du B.O. n°7 du 31 Août
2000 - Hors Série Programme officiel de première scientifique
en SVT
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Notions et contenus | Activités envisageables |
Du génotype au phénotype, relations avec l’environnement
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La diversité des génotypes Le phénotype peut se définir à différentes échelles: de l’organisme à la molécule. Les phénotypes alternatifs sont dus à des différences dans les protéines concernées. |
Analyse d’un exemple comme la drépanocytose ou la phénylcétonurie. Comparaison de la structure des protéines en relation avec l’exemple étudié. |
La synthèse des protéines La séquence des acides aminés des protéines
est imposée par l’information génétique située dans la molécule d’ADN.
Un gène est défini comme une séquence de nucléotides d’un brin d’ADN déterminant
sur divers gènes. la séquence d’un polypeptide donné... |
Exploitation de logiciels sur les modèles moléculaires et structures spatiales de protéines enzymatiques et du complexe enzyme-substrat. Simulation de l’action catalytique d’une enzyme. Utilisation de logiciels relatifs à: |
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Une portion de la phénylalanine hydroxylase est disponible
à la PDB. Elle correspond au site catalytique de la protéine.
La commande Seq3D permet de constatrer que la portion de molécule
s'étend de l'acide aminé 118 à l'acide aminé
452 avec une lacune aux positions 137 - 142. Un atome de fer marque le
site catalytique de l'enzyme. Le fichier comporte un dimère de
l'enzyme, seule une chaîne est représentée ci dessus. |
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Trois substitutions sont localisées en positions 261, 408 et 414 de la molécule. Fichiers Anagène ou Seqaid : Chacune des ces mutations correspondant à une cause de phénylcétonurie. |
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Visualisation de la chaîne résultant de la synthèse de la PAH à partir d'un allèle muté entraînant l'apparition d'un codon stop au niveau du codon 222... Fichiers Anagène ou Seqaid : |
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La page Seq3D permet de visualiser des mutations repérées
à l'aide de logiciels d'exploitation de données génétiques
tels que Seqaid ou Anagène et de constater ainsi l'effet des mutations
sur la séquence en acides aminés de cette molécule. |
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... ou du codon 272. Les chaînes peptidiques correspondantes ont donc une longueur de 221 et 271 acides aminés, alterant largement le fonctionnement de l'enzyme. Fichiers Anagène ou Seqaid : |
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Si votre machine est correctement configurée, pour étudier la molécule 2pah, il suffit de :
Soit d'entrer le code PDB ci dessous dans la case de code d'identification PDB de la page d'entrée |
Soit de Cliquer sur le lien ci-dessous |
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2PAH
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