La drépanocytose et les thalassémies

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Extrait du B.O. n°7 du 31 Aout 2000 - Programme officiel de Première L - Enseignement scientifique

DU GÉNOTYPE AU PHÉNOTYPE, APPLICATIONS BIOTECHNOLOGIQUES

Activités envisageables.

De l'information génétique au phénotype - Applications
Des phénotypes à différents niveaux d'organisation du vivant
Le phénotype peut se définir à différentes échelles : macroscopique, cellulaire et moléculaire.
- Analyse de divers exemples : drépanocytose, phénylcétonurie ou mucoviscidose, xéroderma pigmentosum, rétinites pigmentaires ...


- Observation comparative des séquences de différents allèles et des séquences protéiques correspondantes, conséquences pour le phénotype macroscopique.

 
 
Hémoglobine d'une personne saine.
Hémoglobine d'une personne atteinte d'anémie falciforme.
Les mutations apparaisent en rouge

 
 
La chaîne beta de l'hémoglobine a été extraite de la molécule ( Choisir chaîne B ) dans chacune des 2 molécules puis la page Seq3D permet de faire resortir le 6ème acide aminé de la séquence de la chaîne ou la mutation a été localisée à l'aide d'un logiciel d'étude de séquences tel que Anagène ou Séqaid. La substitution d'un glutamate par une valine est ainsi positionnée dans la chaîne d'acides aminés. 
(Il ne s'agit, ici, que d'une image, aucun lien n'est donc actif.)

 
 
En complément des logiciels Anagène ou Séqaid, Protéine Explorer permet de visualiser l'effet des mutations responsables des thalassémies sur les protéines concernées et ainsi de comprendre la perte de fonction de la molécule liée à la mutation. Ici la chaîne beta de l'hémoglobine est présentée en bleu d'abord complète puis telle qu'elle est synthétisée chez des les malades atteints de thalassémies. La portion synthétisée est "AFFICHER" en Sphères et superposée à un "fantôme" de la molécule complète en Nuages de points.

en bleu : séquence conservée --------- en rouge : séquence modifiée

Chaîne beta complète
des individus sains.

Fichier Anagène ou Seqaid :
Beta.pro 

Chaîne beta de la 
Thalassémie de Chine 1.

Fichier Anagène ou Seqaid :
Tha1.pro

Chaîne beta de la
Thalassémie de Sardaigne.

Fichier Anagène ou Seqaid :
Tha2.pro

Chaîne beta de la
Thalassémie de Méditerranée.

Fichier Anagène ou Seqaid :
Tha4.pro

Chaîne beta de la
Thalassémie de Chine 2.

Fichier Anagène ou Seqaid .
Tha5.pro 


 

Si votre machine est correctement configurée, pour étudier les molécules d'hémoglobines, il suffit de :
 
Soit d'entrer les deux codes PDB des molécules à comparer dans les deux cases de la page d'entrée puis de cliquer sur le bouton Protéine comparator. Soit de Cliquer sur le lien ci-dessous
pour lancer Protéine comparator qui télécharge
automatiquement les molécules indiquées.
2hhb : Hémoglobine saine
2hbs : Hémoglobine drépanocytaire
 
Charger les deux hémoglobines (2hhb et 2hbs)