Les informations ci-dessous proviennent du manuel de référence de RasMol, disponible à http://www.umass.edu/microbio/rasmol/distrib/rasman.htm.

Les coloris cpk de Rasmol sont basés sur les couleurs des modèles moléculaires en plastique qui ont été développés par Corey, Pauling et plus tard améliorés par Koltun. Ces coloris colorent les atomes selon l'élément correspondant. Voici les coloris utilisés conventionnellement par les chimistes. La relation type d'élément - couleur est donné ci-dessous.

    ELEMENT                  NOM de COULEUR     RVB DECIMAL    RVB HEXADECIMAL
    Carbone                    gris clair       [200,200,200]  C8 C8 C8
    Oxygène                    rouge            [240,0,0]      F0 00 00
    Hydrogène                  blanc            [255,255,255]  FF FF FF

    Azote                      bleu clair       [143,143,255]  8F 8F FF
    Soufre                     jaune soufre     [255,200,50]   FF C8 32
    Chlore, Bore               vertgreen        [0,255,0]      00 FF 00

    Phosphore, Fer, Barium     orange           [255,165,0]    FF A5 00
    Sodium                     bleu             [0,0,255]      00 00 FF
    Magnésium                  vert forêt       [34,139,34]    22 8B 22
    Zn, Cu, Ni, Br             brun             [165,42,42]    A5 2A 2A

    Ca, Mn, Al, Ti, Cr, Ag     gris foncé       [128,128,144]  80 80 90
    F, Si, Au                  or               [218,165,32]   DA A5 20
    Iode                       violet           [160,32.240]   A0 20 F0

    Lithium                    rouge brique     [178,34,34]    B2 22 22
    Hélium                     rose             [255,192,203]  FF C0 CB
    Inconnu                    fuchsia          [255,20,147]   FF 14 93